El Consejo Nacional de Educación resguarda y promueve la calidad de la educación superior en el país, a través del licenciamiento de nuevas instituciones de educación superior privadas (IES), se constituye como instancia de apelación de algunas decisiones adoptadas por la Comisión Nacional de Acreditación, participa en los procesos de revocación del reconocimiento oficial de instituciones de educación superior autónomas, sedes o carreras y en la designación de administrador de cierre. En este contexto, el Consejo puede asumir, a solicitud del Ministerio de Educación, la examinación de estudiantes en proceso de titulación de instituciones de educación superior autónomas que están en proceso de cierre.
Asimismo, ha asumido la supervigilancia de CFT Estatales hasta la obtención de su acreditación (Ley N°20.910), la supervisión de instituciones no acreditadas, la supervisión de carreras con acreditación obligatoria no acreditadas.
